Оригинальная история собрана из небольших глав, рассказывающих о парне Тэцуро, который, желая отомстить злодею, пересекает целую галактику. Проделывая своё путешествие, Тэцуро попадает в разные приключения на разных планетах, где знакомится с подводными людьми, людьми-насекомыми, говорящими динозаврами и так далее. Планеты также различны: планета в стиле XX века, планета вечного лета и планета вечной зимы, золотая планета и планета непрекращающихся землетрясений.

1999-й год. Рубеж тысячелетий. Две группы людей, обладающих сверхчеловеческими способностями, сошлись в смертельной битве за судьбу мира. Шестеро из них называют себя Драконами Земли, и их цель - очистить планету от людей, по вине которых природа находится на грани гибели. Но их противники - Драконы Неба - верят в то, что человечество научится жить в гармонии с природой, нужно лишь дать ему немного времени. А пока - любой ценой защитить семь магических барьеров, расположенных в Токио. Шестнадцатилетний Камуи Широу возвращается в Токио, выполняя предсмертную волю матери. Он не знает о том, что Судьба выбрала его на роль главного действующего лица в грядущей схватке Драконов. Ибо пророчество гласит: "Обладающий силой Бога держит в руках судьбу Земли". Имя "Камуи" означает "сила Бога". Но чью сторону выберет юноша, и можно ли изменить предначертанное Судьбой?..

Задолго до начала времен, когда Солнечная система была лишь облаком межзвездной пыли среди ледяного безмолвия хаоса, Великий Генма, чудовищное воплощение вселенского зла, вел яростную битву против всего сущего, поклявшись превратить космос в мертвое Ничто. Миллиарды лет, порабощая тела невинных и подчиняя себе стихии, бесформенный ужас пожирал галактики и созвездия, и теперь на его пути стоит хрупкая и одинокая планета Земля, чья единственная надежда — горстка загадочных сверхлюдей. Эти бесстрашные и мудрые воины способны одним усилием воли воздействовать на предметы с сокрушительной силой, и скоро их ряды пополнят новички, еще не подозревающие о своих способностях — прекрасная и грозная трансильванская принцесса Луна и простой японский школьник Джо. Когда Нью-Йорк будет лежать в руинах, а Токио превратится в песчаную пустыню, они, познав всё могущество своих удивительных сил, вместе с древним боевым роботом Вегой и собратьями воинами выйдут на решающую битву с Великим Генмой.

Они сошлись у ночного костра, ещё не зная, что приготовила им судьба: резчик по дереву, разыскивающий по свету легендарную Жар-Птицу, Аканемару и безжалостный убийца Гао, предводитель разбойников. Той ночью Гао нападает на Аканемару и грабит его, лишь случайно не убив, но серьёзно ранив. Через определённое время им предстоит встретиться вновь... История о том, что душевные муки могут сделать из разбойника великого мастера, а алчность и жажда славы - превратить гения в убийцу.

Два клана ведут войну. Чтобы закончить это кровопролитие, глава клана Ямато отправляет сына в лагерь врага. Огуна должен убить главу вражеского клана, но в силу обстоятельств его ранят, а потом выхаживает Каджика - сестра Каваками Такеро - главы вражеского клана. Между ними вспыхивает любовь. Такеро согласен принять Огуна в клан, а также отдать ему в жёны Каджику. Что выберет Огуна? Остаться и пойти войной против своего клана или выполнить волю отца и убить брата своей возлюбленной.

В далеком космосе терпит крушение космический челнок, и пробужденная из стазиса команда находит пятого члена экипажа мертвым на капитанском мостике. Дрейфуя между звездами и почти оставив надежду на спасение, оставшиеся в живых пытаются выяснить, что же погубило их коллегу. Тут и выясняется, что о прошлом погибшего у них довольно противоречивые сведения.

В мультфильме показаны приключения мальчика Тэцуро, который уничтожает механических людей, желая отомстить за смерть родителей. Механические люди овладели Вселенной и насильно правят ею. Тэцуро, мальчик из захолустного городка, попадает в центр ультрасовременного города, где находится планетарная станция «Мегаполис». От этой станции отходит «Экспресс-Галактика-999», на который пытается попасть Тэцуро. Он крадет билет и его пытается поймать полиция механических людей. Тэцуро неожиданно спасает таинственная Мейтел, с которой он будет вместе путешествовать в «Экспресс-Галактике-999». Мальчик хочет отомстить механическим людям, в частности графу Мекке, за смерть матери, убитой во время охоты на людей. Ему удаётся убить Графа Мекку, но Тэцуро принимает решение поехать на планету Андромеду, где находится фабрика по производству человекоподобных механических людей. По приезду на Адромеду их с Мейтел ожидают еще более захватывающие приключения...

Короткометражный кинофильм является ремейком третьей серии оригинального ТВ-сериала, повествующего о встрече Тэцуро с официанткой Клэйр - эпизод, получивший также отражение в полнометражном кинофильме 1979 года.

Юно Мамия – богачка, красавица и умница – должна была бы влюбиться в прекрасного принца. Но вместо этого, развлекаясь с приятельницами (они разглядывали в бинокль жильцов соседних домов), присмотрела юношу, который скромно онанировал на порножурнал. Ее подруги брезгливо отмахнулись: «Фу, это способно убить даже самую сильную любовь... Мужчины – такие животные!», но нежное сердце Юно было ранено: «Нет, он – хороший! Он просто одинок, и у него нет девушки!». Решение созрело само собой – предложить ему себя в качестве подружки! Сказано, сделано: не успел Рокуро привести себя в порядок после сеанса самообслуживания, как в дверь позвонила прелестная старшеклассница с предложением: а не нужна ли ему девушка?

Галактический экспресс - космический челнок сделанный в ретро стиле начало ХХ века, этакая ностальгия по прошлому, безвозвратно утерянному. Ведь на борту его люди делающие шаг к бесконечности жизни и поезд место где ты оставляешь частичку себя, потому что на последней остановке назад пути не будет. Фильм затрагивающий аспекты психологии любого человека в любом возрасте, ведь каждый когда то думал в детстве что бессмертен, а понимание того что смерть рано или поздно настигнет, повергает в шок. Но что такое бесконечность бытия в сравнении с коротким периодом с названием жизнь, где каждый миг существования поневоле приходиться ценить, потому что большего нам не дано и мы не боги в конце концов чтобы жить бесконечно. Вот и наш герой с каждой остановкой галактического экспресса попадает в различные авантюры, и вскоре приходит к переосмысливанию ценностей.

Акира – обычный подросток, который живёт в современном Токио. Однажды, он встречает своего старого друга Рё, и, после этой встречи, заурядная жизнь Акиры подходит к концу. Он узнает, что демоны существуют еще с начала времен, а с появлением человечества, они начали вести скрытую войну за власть над миром людей. Теперь, будучи втянутыми в эту неравную войну, Акира и Рё решаются на отчаянные меры: чтобы победить, они должны провести опасный ритуал и создать единственную надежду человечества – могущественного Человека-дьявола!

Человечество переселяется в космос и, чтобы контролировать взбунтовавшиеся умы, государство вводит новые меры контроля: проверки подростков на телепатию, экзамен на зрелость, выращивание детей из пробирок и многое другое. За управление людьми отвечает суперкомпьютер- Мать Элиза, также проверяющая подростков на зрелость и пресекающая любые попытки сбежать с планеты Терра. Главный герой — Джомми Маркшин в 14 лет отправляется, как и все подростки, сдавать экзамен на зрелость. Но здесь его поджидают внезапные открытия — перед экзаменом компьютер стирает экзаменуемому память и отправляет человека в другой мир. Такие условия Джомми не по вкусу , поэтому воспользовавшись предоставленным космолетом он улетает на другую планету- Арисака, и именно там знакомится с другими представителями мутации Мью, их лидером и очаровательной мышкой, владеющей телепатией.

Спецвыпуск "Ты можешь жить как воин?!" создан на основе ТВ серии "Галактического экспресса 999" "Воитель камней" и повествует о приключениях Тэцуро и Мэйтел на окаменевшей планете. Несмотря на то, что во многом этот спешл повторяет содержание сериала, в нём было добавлено множество новых событий. Прежде всего это касается отношений воина Юлиуса и его невесты Лидии, в ходе которых перед зрителем предстаёт подлинная трагедия воина, чтущего бусидо, поставленного волей судьбы перед нелёгким выбором: спасти любимую девушку, потеряв при этом честь воина, либо же во имя чести потерять всё остальное?

Ремейки двадцать второй серий «Галактического экспресса 999» о встречах Тэцуро Хошино с королевой пиратов Эмеральдас, транслировался в промежутке между 71-й и 72-й сериями.

Третий спецвыпуск "Галактического экспресса 999" - "Ты можешь любить как мать?!" создан на основе серий 51-52 "Артемис из Прозрачного Моря" - одного из самых драматичных мест в сериале, и отличается более полным освещением событий, происшедших с Артемис на Кибернии - планете её мечты. Много внимания уделено размышлениям Тэцуро о цели его путешествия, почему на это была воля его мамы, и что такое, в конце концов, - материнская любовь?

2024 год. Практически вся поверхность Земли была уничтожена падением огромного метеорита. В начавшемся после ужасающей катастрофы хаосе таинственная военная организация «Трейдер Форс» полностью узурпировала власть над планетой. Человечество погрузилось в новую тёмную эру под предводительством безжалостных тиранов. И теперь единственная надежда для медленно умирающей Земли — это загадочная инопланетянка по имени Мелло, как-то связанная с падением того самого метеорита.