Действие фильма разворачивается после первого сезона «Приключений Дигимонов». «Избранные» дети живут обычной жизнью: учатся, знакомятся с новыми людьми, ходят к друзьям и путешествуют. Однако в один ничем не примечательный день в Интернете появляется яйцо дигимона, сплошь состоящее из ошибок. Заподозрив неладное, Косиро спешит к своему другу Таити, проясняя ситуацию. Тем временем вылупившийся дигимон начал съедать данные всей компьютерной сети, тем самым ломая многочисленные системы. Теперь «избранным» необходимо спасти не только Всемирную паутину, но и весь мир от полнейшего хаоса, принесённого этим неизвестным существом.

Америка, Нью-Йорк. Это именно то место, куда отправились на каникулы трое «избранных» детей — Хикари, Такэру и Мими. Когда ребята решают в очередной раз сфотографироваться, из ниоткуда появляется мистический ветер, который, пролетев полмира, заставил исчезнуть многих «избранных», и сейчас он унёс Мими. Одновременно с этим своего давно пропавшего друга-дигимона ищет таинственный паренёк. Смогут ли оставшиеся «избранные» помочь этому ребёнку? И справятся ли они с новой угрозой?

После событий, произошедших во втором полнометражном фильме, все наконец-то налаживается, если не считать того, что уже знакомый всем вирус вновь начинает появляться в компьютерных системах Японии. И не только на компьютерах, а также телевизорах, мобильных устройствах, видео-играх имеющим доступ в интернет. Кажется, этот вирус пытается найти кого-то. И этот кто-то Ягами Тайчи, и Исида Ямато, которые одержали над ним победу несколько лет назад. Получается, что этот Дигимон-медуза на самом деле Дигимон Дьяволомон, типа вирус, который был побежден во втором полнометражном фильме. Но на этот раз, он научился создавать своих клонов, и отправлять тысячи своих копий в реальный мир. Куширо и Кен начинают разрабатывать план, который избавит мир от вируса раз и навсегда. Для этого им необходимо объединить всех друзей, ведь только совместными уcилиями возможно победить сильного противника.

В современном мире был создан виртуальный мир, зовущийся Цифровым. Дигимоны — обитатели этого мира — живут тут и радуются жизнью. Но внезапно мир обернулся в хаос. Причина тому — Иггдрасиль, создатель всего живого в виртуальности, который разработал «X-программу». Её целью является уничтожение всех и вся, дабы на месте этого мира создать новый, специально для одного-единственного существа. Однако на это самое существо открыли охоту «Королевские рыцари» — приспешники Иггдрасиля и защитники Цифрового мира.

Эриол-кун, Шаоран-кун, Томоё-тян и Мэйлин-тян чаёвничают у Сакуры в гостиной. Соответственно, Керо-тян и Суппи остаются в комнате Сакуры, и, чтобы они не скучали, им приносят такояки (такояки - мясо осьминога в смеси теста, капусты, и имбиря). Наша пара накидывается на еду, и уже через несколько секунд на тарелке остаётся лишь один такояки. Ну и понеслось...

Главный герой Кэнсин, пытается остановить переворот, который задумал Сисио и его соратники. В Токио готовиться череда военных восстаний и мятежей, и Кэнсей спешит туда, чтобы не допустить свержение нынешней власти. По дороге он встречает отряд ниндзя Онивабан-сю, одной из участниц которого является девушка Макимати Мисао. Именно с точки зрения этой девушки авторы решили преподнести сюжет последней ОВА. Отряд ниндзя тоже решает помочь Кэнсину, который собирается противостоять Сисио. Пройдя обучение у учителя Хико Сэйдзюро, достигнув своего мастерства, Кэнсну удастся одолеть противника. А зрители получат удовольствие еще раз вернуться к любимому сюжету и героев, в которых авторы вдохнули новую жизнь.

Короткометражный фильм рассказывает о самом значительном событии в Цифровом мире, проводящемся каждый год — Гран-при дигимонов, в котором выбирают короля дигимонов. В нём принимают участие дигимоны из первого и второго сезонов. Кто же в этом году станет королём дигимонов?

Обычная подготовка подростков к летнему лагерю прервалась самым неожиданным образом. Вместе со своим соседом Тайчи узнаёт причину беспорядков. Вся электроника в мегаполисе вышла из строя. Мальчишка понимает, что его родственники, мать и сестра, теперь находятся в огромной опасности. Поезд, на который они сели, находится неизвестно где и, скорее всего, похищен неведомой силой. Необходимо остановить его, и они бегут на ближайшую железнодорожную станцию. Но именно там он внезапно переносится в параллельный, цифровой мир. Именно здесь, в виртуальном Токио, находится причина неприятностей. Кто-то захотел проникнуть в настоящий мир, чтобы обрести власть. Встреча со сражающимся дигимоном становится только началом новых приключений героев. Надежде на спокойную жизнь осуществиться не дано.