В здании телевидения Нитиури, в котором проходит Кубок Сацуки на соискание победителя в японском Хякунин Иссю, происходит взрыв. Инцидент приводит к большому волнению, и, хотя здание сгорает дотла, единственные люди, оставшиеся внутри, — это Хэйджи и Казуха. Но их спасает Конан, который вовремя успел на место происшествия. Личность и цели террориста неизвестны. Одновременно с этим в японском доме в Арасияме, пригород Киото, находят тело действующего чемпиона Кубка Сацуки. Фотографии с места преступления указывают на причастность Момиджи, поскольку рядом с телом жертвы был разложены карты каруты. Конан и Хэйджи, при поддержке полицейских департамента Осаки и Киото, берутся за расследование случившегося на Кубке Сацуки и связанного с ним убийства. В ходе следственных мероприятий парочка сталкивается с тайной о Хякунин Иссю.

Сатоши и его друзья отправляются в Ларусс, где они встречают мальчика по имени Тоои, который после перенесённой четыре года назад психологической травмы боится покемонов. В это время полностью оправившийся после боя Деоксис атакует Хоэнн, установив барьер вокруг города и похищая людей. Покемон по имени Рейкваза, живущий в озоновом слое Земли, приходит, дабы одолеть его.